病因HSV-2是生殖器疱疹的主要病原体（90%），传染后引起初发生殖器疱疹。初发生殖器疱疹消退后，残存的病毒经周围神经沿神经轴转移骶神经节而长期潜伏下来，当机体抵抗力降低或某些激发因素如发热、受凉、感染、月经、胃肠功能紊乱、创伤等作用下，可使潜伏的病毒激活，病毒下行皮肤黏膜表面引起病损，导致复发。人类是疱疹病毒的惟一宿主，离开人体则病毒不能生存，紫外线、乙醚及一般消毒剂均可使之灭活。
症状初发生殖器疱疹分为原发性生殖器疱疹和非原发的初发生殖器疱疹。前者为第一次感染HSV而出现症状者为原发性生殖器疱疹。其病情相对严重。而部分病人既往有过HSV-1感染（主要为口唇或颜面疱疹）又再次感染HSV-2而出现生殖器疱疹的初次发作，为非原发的初发生殖器疱疹，其病情相对较轻。
危害外生殖器或肛门周围群簇小水疱，很快破溃形成糜烂或浅溃疡
中医治疗生殖器疱疹的优势主要采用抗病毒治疗。治疗的目的主要是缓解症状，减轻疼痛，缩短病程及防止继发感染等。清除病毒、消除复发的效果。
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